Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXZ2

DDX43, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX43Q9NXZ2 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
DDX43Q9NXZ2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DDX43Q9NXZ2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms