Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXV6

CDKN2AIP, CDKN2A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AIPQ9NXV6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CDKN2AIPQ9NXV6 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CDKN2AIPQ9NXV6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms