Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
KCND1Q9NSA2 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KCND1Q9NSA2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms