Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
VPS45Q9NRW7 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
VPS45Q9NRW7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms