Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
SSU72Q9NP77 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SSU72Q9NP77 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms