Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2K0

MTIF3, Translation initiation factor IF-3, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTIF3Q9H2K0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
MTIF3Q9H2K0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
MTIF3Q9H2K0 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms