Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NACA2Q9H009 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NACA2Q9H009 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms