Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MAP1LC3CQ9BXW4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
MAP1LC3CQ9BXW4 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms