Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SYT17Q9BSW7 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
SYT17Q9BSW7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
SYT17Q9BSW7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms