Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRQ0

PYGO2, Pygopus homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYGO2Q9BRQ0 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PYGO2Q9BRQ0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PYGO2Q9BRQ0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms