Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAAF1Q9BRP4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PAAF1Q9BRP4 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms