Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RBBP8Q99708 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RBBP8Q99708 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
RBBP8Q99708 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RBBP8Q99708 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms