Protein–RNA interactions for Protein: Q96TC7

RMDN3, Regulator of microtubule dynamics protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN3Q96TC7 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RMDN3Q96TC7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RMDN3Q96TC7 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms