Protein–RNA interactions for Protein: Q96T60

PNKP, Bifunctional polynucleotide phosphatase/kinase, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKPQ96T60 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PNKPQ96T60 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PNKPQ96T60 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms