Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK5RAP2Q96SN8 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDK5RAP2Q96SN8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms