Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CITED4Q96RK1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CITED4Q96RK1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms