Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NLRP3Q96P20 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NLRP3Q96P20 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms