Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CHAMP1Q96JM3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CHAMP1Q96JM3 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms