Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ABCC12Q96J65 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ABCC12Q96J65 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ABCC12Q96J65 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms