Protein–RNA interactions for Protein: Q96EL3

MRPL53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL53Q96EL3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
MRPL53Q96EL3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MRPL53Q96EL3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms