Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KIFAP3Q92845 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KIFAP3Q92845 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms