Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TSC1Q92574 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TSC1Q92574 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms