Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
UBE2Q2Q8WVN8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBE2Q2Q8WVN8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBE2Q2Q8WVN8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms