Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEC5

SH3RF2, Putative E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF2, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF2Q8TEC5 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SH3RF2Q8TEC5 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SH3RF2Q8TEC5 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms