Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDC3

BRSK1, Serine/threonine-protein kinase BRSK1, humanhuman

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRSK1Q8TDC3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
BRSK1Q8TDC3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BRSK1Q8TDC3 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms