Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCU1

CCDC197, Putative uncharacterized protein CCDC197, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC197Q8NCU1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
CCDC197Q8NCU1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC197Q8NCU1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms