Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HERC6Q8IVU3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HERC6Q8IVU3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms