Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
UBE3BQ7Z3V4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
UBE3BQ7Z3V4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms