Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3S7

CACNA2D4, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D4Q7Z3S7 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CACNA2D4Q7Z3S7 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNA2D4Q7Z3S7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNA2D4Q7Z3S7 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms