Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SND1Q7KZF4 PIGT-262ENST00000640542 2169 ntTSL 512.34□□□□□ -0.433e-7■■■■□ 20
SND1Q7KZF4 PIGT-223ENST00000638641 2164 nt11.84□□□□□ -0.517e-7■■■■□ 20
SND1Q7KZF4 PIGT-216ENST00000638415 1738 ntTSL 511.8□□□□□ -0.523e-7■■■■□ 20
SND1Q7KZF4 PIGT-247ENST00000639664 1878 ntTSL 511.69□□□□□ -0.543e-7■■■■□ 20
SND1Q7KZF4 PIGT-249ENST00000639872 1498 ntTSL 211.65□□□□□ -0.547e-7■■■■□ 20
SND1Q7KZF4 PIGT-225ENST00000638689 4314 ntTSL 511.38□□□□□ -0.593e-7■■■■□ 20
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SND1Q7KZF4 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.132e-7■■■■□ 19.9
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SND1Q7KZF4 TMBIM6-206ENST00000546914 521 ntTSL 411.41□□□□□ -0.583e-12■■■■□ 19.8
SND1Q7KZF4 TMBIM6-216ENST00000549130 446 ntTSL 58.55□□□□□ -1.043e-12■■■■□ 19.8
SND1Q7KZF4 PDIA6-206ENST00000489662 564 ntTSL 413.37□□□□□ -0.275e-11■■■■□ 19.8
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SND1Q7KZF4 SLC38A2-211ENST00000552414 566 ntTSL 39.45□□□□□ -0.95e-23■■■■□ 19.8
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SND1Q7KZF4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.396e-27■■■■□ 19.8
SND1Q7KZF4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.236e-27■■■■□ 19.8
SND1Q7KZF4 NMU-206ENST00000515325 616 ntTSL 38.61□□□□□ -1.036e-27■■■■□ 19.8
SND1Q7KZF4 NMU-204ENST00000509371 283 ntTSL 1 (best)5.11□□□□□ -1.596e-27■■■■□ 19.8
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