Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV60

LINC00173, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00173, humanhuman

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00173Q6ZV60 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC00173Q6ZV60 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms