Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL3Q6DD88 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATL3Q6DD88 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms