Protein–RNA interactions for Protein: Q5TDP6

LGSN, Lengsin, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGSNQ5TDP6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LGSNQ5TDP6 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGSNQ5TDP6 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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