Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
KHDC3LQ587J8 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
KHDC3LQ587J8 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms