Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
ALFQ53S48 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALFQ53S48 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms