Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PTPRNQ16849 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PTPRNQ16849 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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