Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD1Q16676 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
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FOXD1Q16676 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
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FOXD1Q16676 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
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FOXD1Q16676 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
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FOXD1Q16676 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AC090572.2-201ENST00000520649 761 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD1Q16676 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
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