Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CTF1Q16619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CTF1Q16619 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
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CTF1Q16619 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CTF1Q16619 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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