Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TRAM1Q15629 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TRAM1Q15629 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
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