Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
PDK3Q15120 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PDK3Q15120 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms