Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAM2Q15035 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRAM2Q15035 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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