Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
KLF9Q13886 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF9Q13886 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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