Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ITGB3BPQ13352 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ITGB3BPQ13352 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ITGB3BPQ13352 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms