Protein–RNA interactions for Protein: Q13127

REST, RE1-silencing transcription factor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RESTQ13127 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RESTQ13127 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RESTQ13127 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RESTQ13127 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RESTQ13127 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RESTQ13127 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RESTQ13127 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RESTQ13127 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RESTQ13127 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
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