Protein–RNA interactions for Protein: Q13094

LCP2, Lymphocyte cytosolic protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCP2Q13094 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
LCP2Q13094 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
LCP2Q13094 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms