Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC15Q0P6D6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC15Q0P6D6 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms