Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HSF1Q00613 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HSF1Q00613 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms