Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HBBP68871 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HBBP68871 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HBBP68871 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
HBBP68871 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
HBBP68871 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms