Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TMEM258P61165 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
TMEM258P61165 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms