Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
DEFA3P59666 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
DEFA3P59666 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms